PF07276 - Apopolysialoglycoprotein (PSGP)

PF07276 Protein family information

P12027

Interpro sequence information P12027

Sequence:

>sp|P12027|PSGP_ONCMY Polysialoglycoprotein OS=Oncorhynchus mykiss OX=8022 PE=1 SV=2
MIMGGVRELLLVVMTVGVVKVSCYPVGKSQKQDQVSLQRRLGELSSNDVSIVHALALLRS
IGSDAKQAREEYLETNEVESQASPNHGSSPANDALSSEEKLRRVSSDDAATSEAATGPSG
DDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAA
TGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDA
TSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGP
SGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSE
AATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGD
DATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAAT
GPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDATSEAATGPSGDDAM
DI

MRF results:

Region 1: 107-536,    14 aa length,   33  units
DDAATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG
DD-ATSEAATGPSG

TAPAS results:

_images/tapasP12027.png

Alphafold results - spectrum b

_images/P12027alphafold.png

Alphafold results - units from MRF

_images/P12027alphafoldUnits.png